海水淡化标准因用途不同而有所差异，主要包括生活饮用水标准和工业用水标准等，具体如下：
生活饮用水标准1：我国现行的生活饮用水国家标准是《生活饮用水卫生标准》（GB 5749-2022），海水淡化后作为生活饮用水，需符合该标准。例如，硝酸盐检出量不应超过 10 毫克 / 升、任何大肠杆菌等致病菌不应检出等。一些城市还发布了更严格的地方标准，如广东省深圳市现行的《生活饮用水水质标准》（DB4403/T 60-2020）中，硼元素的限值为 0.5 毫克 / 升，低于国家标准的 1 毫克 / 升。
工业用水标准2：根据 GB/T39481-2020《海水淡化工业用水水质标准》，不同工业场景对海水淡化水有不同指标要求。如作为锅炉补给水，溶解性总固体≤20mg/L，总硬度≤1.0mg/L，铁含量≤0.01mg/L；作为循环冷却水 / 工艺用水，溶解性总固体≤500mg/L，总硬度≤50mg/L，铁含量≤0.3mg/L。
此外，青岛市发布的地方标准《海水淡化生活饮用水集中式供水单位卫生管理规范》（DB3702/FW WJW02-2017），对海水淡化集中式供水单位的水源选择、生产过程、水质卫生等方面都做出了详细规定3。国际上，由我国主导制定的《海洋技术 - 反渗透海水淡化产品水水质 - 市政供水指南》于 2021 年发布，可规范并简化海水淡化产品水的水质检测，保证管网和终端用水安全7。
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